（Douglas G.M., et al. Nat. Biotechnol. 2020. “PICRUSt2 for prediction of metagenome functions” PMID: 32483366 より）
学部内で進めている共同研究（科研費ほか）のために、細菌叢メタゲノム解析（16S rRNAマーカー遺伝子）の結果から機能予測を行うソフトウェア「PICRUSt2」を、当機器センターの計算サーバー内に整備しました。
半自動パイプラインとしてシェルスクリプト、テキストパーサーなども作成し、汎用的に運用できるようにしました。
現在分析しているサンプルで、例えば喫煙ありの検体でニコチン代謝経路の活性が強く検出されるなど（他にもベンゼン環系化合物の代謝経路が多く検出されています）、予測精度の高さが伺えます。
（機器センター・佐藤）
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